विटामिन डी अवशोषण के लिए एक स्वस्थ आंत अस्तर आवश्यक है। IBS, Celiac रोग, या यहां तक कि पुरानी सूजन जैसी स्थितियां पोषक तत्वों के साथ हस्तक्षेप कर सकती हैं। विटामिन डी, वसा में घुलनशील होने के नाते, आंतों से उचित पित्त प्रवाह और एंजाइम गतिविधि पर निर्भर करता है। एक सुस्त या सूजन वाली आंत चुपचाप पूरक को तोड़फोड़ कर सकती है।
किण्वित खाद्य पदार्थ, प्रोबायोटिक्स और फाइबर विविधता आंत को मजबूत करने में मदद कर सकती है और बदले में, विटामिन डी प्रभावशीलता को बढ़ावा देती है।