कुछ व्यक्ति गुर्दे की संरचनात्मक असामान्यताओं या वंशानुगत विकारों के साथ पैदा होते हैं। उदाहरणों में पॉलीसिस्टिक किडनी रोग, एलपोर्ट सिंड्रोम और जन्मजात रुकावटें शामिल हैं। चूँकि गुर्दे विकृत हो सकते हैं या आनुवंशिक रूप से कमज़ोर हो सकते हैं, प्रोटीन का रिसाव जीवन की शुरुआत में ही दिखाई दे सकता है।
ये स्थितियाँ मूत्र प्रवाह के पैटर्न या खनिज प्रसंस्करण पर भी प्रभाव डाल सकती हैं। खराब जल निकासी, बार-बार संक्रमण, या असामान्य ऊतक वृद्धि गुर्दे की पथरी बनने के लिए आदर्श स्थिति प्रदान कर सकती है। जन्मजात किडनी विकार वाले व्यक्तियों को आमतौर पर जीवन भर निगरानी की आवश्यकता होती है। प्रोटीनुरिया का शीघ्र निदान और पथरी का शीघ्र निकास अक्सर बाद में अधिक गंभीर जटिलताओं को टाल सकता है।
क्रोनिक रीनल संक्रमण, बार-बार होने वाले मूत्र पथ के संक्रमण या किडनी में पुरानी सूजन समय के साथ ऊतकों को धीरे-धीरे कमजोर कर सकती है। प्रगति के साथ, यह एक कम प्रभावी निस्पंदन प्रणाली बन जाती है जो प्रोटीन को मूत्र में जाने की अनुमति देना शुरू कर देती है। क्रोनिक संक्रमण भी पथरी के निर्माण को प्रोत्साहित करने के लिए जाने जाते हैं क्योंकि वे मूत्र के पीएच को बदलते हैं, बैक्टीरिया के निर्माण को बढ़ाते हैं, और मलबे का निर्माण करते हैं जो पथरी के विकास के लिए बीज के रूप में कार्य करते हैं। एक प्रकार का पत्थर, जिसे स्ट्रुवाइट पत्थर कहा जाता है, किसी संक्रमण की प्रतिक्रिया में बन सकता है। ये पथरी काफी बड़ी हो सकती हैं और गुर्दे की श्रोणि का आकार लेकर उसे भर सकती हैं। इसलिए, त्वरित उपचार और संक्रमण की पुनरावृत्ति की रोकथाम किडनी कार्य सुरक्षा में महत्वपूर्ण है।
